《財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于運(yùn)輸費(fèi)用和廢舊物資準(zhǔn)予抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額問題的通知》(財(cái)稅字[1994]012號(hào))規(guī)定：對(duì)增值稅一般納稅人外購(gòu)貨物(固定資產(chǎn)除外)所支付的運(yùn)輸費(fèi)用，根據(jù)運(yùn)費(fèi)結(jié)算單據(jù)(普通發(fā)票)所列運(yùn)費(fèi)金額依10%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額準(zhǔn)予扣除，但隨同運(yùn)費(fèi)支付的裝卸費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)等其他雜費(fèi)不得計(jì)算扣除進(jìn)項(xiàng)稅額。

《財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于增值稅幾個(gè)稅收政策問題的通知》(財(cái)稅字[1994]60號(hào))規(guī)定：增值稅一般納稅人1994年5月1日以后銷售應(yīng)稅貨物而支付的運(yùn)輸費(fèi)用，除《增值稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》第12條所規(guī)定的不并入銷售額的代墊運(yùn)費(fèi)以外，可按《財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于運(yùn)輸費(fèi)用和廢舊物資準(zhǔn)予抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額問題的通知》中有關(guān)規(guī)定，依10%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額予以抵扣。納稅人購(gòu)買或銷售免稅貨物所發(fā)生的運(yùn)輸費(fèi)用，不得計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣。

《財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于調(diào)整增值稅運(yùn)輸費(fèi)用扣除率的通知》(財(cái)稅字[1998]114號(hào))規(guī)定：經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)，從1998年7月1日起，將增值稅一般納稅人購(gòu)進(jìn)或銷售應(yīng)稅貨物支付的運(yùn)輸費(fèi)用的扣除率由10%降低為7%.凡1998年7月1日以后申報(bào)抵扣的運(yùn)輸費(fèi)用進(jìn)項(xiàng)稅額，不論運(yùn)輸發(fā)票何時(shí)開具，其所注明的運(yùn)輸費(fèi)用是否已經(jīng)支付，均按7%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額。

上述三個(gè)文件明確了一般納稅人所發(fā)生的運(yùn)費(fèi)，應(yīng)為外購(gòu)貨物(固定資產(chǎn)和免稅貨物除外)和銷售應(yīng)稅貨物所發(fā)生的運(yùn)費(fèi)，才可用于增值稅進(jìn)項(xiàng)稅抵扣。

二、取得規(guī)定的運(yùn)費(fèi)單證并且按規(guī)定的范圍才可用于增值稅進(jìn)項(xiàng)稅抵扣

(一)總體要求

《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈增值稅問題解答(之一)〉的通知》(國(guó)稅函發(fā)[1995]288號(hào))第1條規(guī)定：1.增值稅一般納稅人外購(gòu)貨物(固定資產(chǎn)除外)所支付的運(yùn)輸費(fèi)用，準(zhǔn)予抵扣的運(yùn)費(fèi)結(jié)算單據(jù)(普通發(fā)票)，是指國(guó)營(yíng)鐵路、民用航空、公路和水上運(yùn)輸單位開具的貨票，以及從事貨物運(yùn)輸?shù)姆菄?guó)有運(yùn)輸單位開具的套印全國(guó)統(tǒng)一發(fā)票監(jiān)制章的貨票。2.準(zhǔn)予抵扣的貨物運(yùn)費(fèi)金額是指在運(yùn)輸單位開具的貨票上注明的運(yùn)費(fèi)、建設(shè)基金，不包括隨同運(yùn)費(fèi)支付的裝卸費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)等其他雜費(fèi)。第2條：增值稅一般納稅人采取郵寄方式銷售、購(gòu)買貨物所支付的郵寄費(fèi)，不允許計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣。

《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于加強(qiáng)增值稅征收管理若干問題的通知》(國(guó)稅發(fā)[1995]192號(hào))規(guī)定：1.準(zhǔn)予計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額扣除的貨運(yùn)發(fā)票種類。根據(jù)規(guī)定，增值稅一般納稅人外購(gòu)和銷售貨物(固定資產(chǎn)除外)所支付的運(yùn)輸費(fèi)用，準(zhǔn)予抵扣的運(yùn)費(fèi)結(jié)算單據(jù)(普通發(fā)票)，是指國(guó)營(yíng)鐵路、民用航空、公路和水上運(yùn)輸單位開具的貨票，以及從事貨物運(yùn)輸?shù)姆菄?guó)有運(yùn)輸單位開具的套印全國(guó)統(tǒng)一發(fā)票監(jiān)制章的貨票。準(zhǔn)予計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額扣除的貨運(yùn)發(fā)票種類，不包括增值稅一般納稅人取得的貨運(yùn)定額發(fā)票。2.準(zhǔn)予計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額扣除的貨運(yùn)發(fā)票，其發(fā)貨人、收貨人、起運(yùn)地、到達(dá)地、運(yùn)輸方式、貨物名稱、貨物數(shù)量、運(yùn)輸單位、運(yùn)費(fèi)金額等項(xiàng)目的填寫必須齊全，與購(gòu)貨發(fā)票上所列的有關(guān)項(xiàng)目必須相符，否則不予抵扣。3.納稅人購(gòu)進(jìn)、銷售貨物所支付的運(yùn)輸費(fèi)用明顯偏高、經(jīng)過審查不合理的，不予抵扣運(yùn)輸費(fèi)用。

(二)管道運(yùn)輸

《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于增值稅若干征管問題的通知》(國(guó)稅發(fā)[1996]155號(hào))規(guī)定：增值稅一般納稅人外購(gòu)和銷售貨物(固定資產(chǎn)除外)所支付的管道運(yùn)輸費(fèi)用，可以根據(jù)套印有全國(guó)統(tǒng)一發(fā)票監(jiān)制章的運(yùn)輸費(fèi)用結(jié)算單據(jù)(普通發(fā)票)所列運(yùn)費(fèi)金額，按10%計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣。(注：從1998年7月1日起，扣除率由10%降低為7%.)(三)鐵路運(yùn)輸。

《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于鐵路運(yùn)費(fèi)進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣有關(guān)問題的通知》(國(guó)稅發(fā)[2000]14號(hào))規(guī)定：增值稅一般納稅人購(gòu)進(jìn)或銷售貨物(固定資產(chǎn)除外)所支付的鐵路運(yùn)輸費(fèi)用，準(zhǔn)予抵扣的范圍限于鐵路運(yùn)輸部門開具的貨票上注明的以下項(xiàng)目：運(yùn)輸運(yùn)營(yíng)費(fèi)用(即發(fā)到運(yùn)費(fèi)和運(yùn)行運(yùn)費(fèi));鐵路建設(shè)基金;臨管鐵路運(yùn)費(fèi)(包括：**煤運(yùn)費(fèi)、**煤運(yùn)費(fèi)、**煤運(yùn)費(fèi)、豐沙大煤運(yùn)費(fèi)、京九分流加價(jià)、太古嵐加價(jià)、京九運(yùn)費(fèi)、大沙運(yùn)費(fèi)、侯月運(yùn)費(fèi)、**運(yùn)費(fèi)、**運(yùn)費(fèi)、**運(yùn)費(fèi)、**運(yùn)費(fèi)、塔-韓運(yùn)費(fèi)、北侖運(yùn)費(fèi))。

《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于合九鐵路運(yùn)費(fèi)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額問題的批復(fù)》(國(guó)稅函[2000]1037號(hào))規(guī)定：合九鐵路運(yùn)輸費(fèi)用中的“鐵路貨物運(yùn)費(fèi)”和“代收國(guó)鐵運(yùn)費(fèi)”，其性質(zhì)與《國(guó)家稅務(wù)總關(guān)于鐵路運(yùn)費(fèi)進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣有關(guān)問題的通知》(國(guó)稅發(fā)[2000]14號(hào))中列舉的準(zhǔn)予抵扣的運(yùn)費(fèi)項(xiàng)目相同。因此，對(duì)合九鐵路的上述兩項(xiàng)鐵路運(yùn)費(fèi)，可列入增值稅的進(jìn)項(xiàng)稅額予以抵扣。

《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于鐵路運(yùn)費(fèi)進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣有關(guān)問題的補(bǔ)充通知》(國(guó)稅函[2003]970號(hào))規(guī)定：(一)除《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于鐵路運(yùn)費(fèi)進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣有關(guān)問題的通知》(國(guó)稅發(fā)[2000]14號(hào))中規(guī)定的抵扣項(xiàng)目外，對(duì)鐵路運(yùn)輸部門開具新增的北疆線、西康線、上鉛線、內(nèi)六線、福前線、塔十線、廣深線、南疆線貨票運(yùn)費(fèi)，允許按7%的扣除率計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。(二)中國(guó)鐵-路包裹快運(yùn)公司(簡(jiǎn)稱**快運(yùn))為客戶提供運(yùn)輸勞務(wù)，屬于鐵路運(yùn)輸企業(yè)。因此，對(duì)增值稅一般納稅人購(gòu)進(jìn)或銷售貨物取得的《中國(guó)鐵-路小件貨物快運(yùn)運(yùn)單》列明的鐵路快運(yùn)包干費(fèi)、超重費(fèi)、到付運(yùn)費(fèi)和轉(zhuǎn)運(yùn)費(fèi)，可按7%的扣除率計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。

(四)公路、內(nèi)河運(yùn)輸。對(duì)于公路、內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)的運(yùn)輸發(fā)票抵扣管理，《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于加強(qiáng)貨物運(yùn)輸業(yè)稅收征收管理有關(guān)問題的通知》(國(guó)稅發(fā)明電[2003]55號(hào))規(guī)定：1.增值稅一般納稅人取得稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)定為自開票納稅人的聯(lián)運(yùn)單位和物流單位開具的貨物運(yùn)輸業(yè)發(fā)票準(zhǔn)予計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。2.準(zhǔn)予抵扣的貨物運(yùn)費(fèi)金額是指自開票納稅人和代開票單位為代開票納稅人開具的貨票上注明的運(yùn)費(fèi)、建設(shè)基金和現(xiàn)行規(guī)定允許抵扣的其他貨物運(yùn)輸費(fèi)用，裝卸費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)和其他雜費(fèi)不予抵扣。貨運(yùn)發(fā)票應(yīng)當(dāng)分別注明運(yùn)費(fèi)和雜費(fèi)，對(duì)未分別注明，而合并注明為運(yùn)雜費(fèi)的不予抵扣。

《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于使用公路、內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票有關(guān)問題的通知》(國(guó)稅函[2004]557號(hào))規(guī)定：從2004年7月1日起，統(tǒng)一使用公路、內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票(以下簡(jiǎn)稱《貨運(yùn)發(fā)票》)。凡在中華人民共和國(guó)境內(nèi)提供公路、內(nèi)河貨物運(yùn)輸勞務(wù)的單位和個(gè)人，在結(jié)算運(yùn)輸勞務(wù)費(fèi)用，收取運(yùn)費(fèi)時(shí)，必須開具《貨運(yùn)發(fā)票》。《貨運(yùn)發(fā)票》按使用對(duì)象不同分為“公路、內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票(以下簡(jiǎn)稱自開發(fā)票)”和“公路、內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票(代開)(以下簡(jiǎn)稱代開發(fā)票)”兩種。自開發(fā)票由自開票納稅人領(lǐng)購(gòu)和開具;代開發(fā)票由代開單位領(lǐng)購(gòu)和開具;代開發(fā)票由稅務(wù)機(jī)關(guān)代開時(shí)，稅務(wù)機(jī)關(guān)為代開單位;代開票納稅人應(yīng)當(dāng)?shù)蕉悇?wù)機(jī)關(guān)指定的代開單位辦理代開發(fā)票事宜。

《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)新版《全國(guó)聯(lián)運(yùn)行業(yè)貨運(yùn)統(tǒng)一發(fā)票》式樣的通知》(國(guó)稅函[2004]1033號(hào))規(guī)定：新版《聯(lián)運(yùn)發(fā)票》的啟用時(shí)間。各地收到本通知后，即可啟用新版《聯(lián)運(yùn)發(fā)票》，舊版《聯(lián)運(yùn)發(fā)票》2004年10月30日起停止使用。

因此，一般納稅人所發(fā)生的公路、內(nèi)河運(yùn)費(fèi)，應(yīng)取得上述《貨運(yùn)發(fā)票》和《聯(lián)運(yùn)發(fā)票》，才可用于增值稅進(jìn)項(xiàng)抵扣。

三、申請(qǐng)運(yùn)費(fèi)抵扣的時(shí)限和程序

對(duì)于公路、內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)的運(yùn)輸發(fā)票申請(qǐng)抵扣時(shí)限，《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于貨物運(yùn)輸業(yè)若干稅收問題的通知》(國(guó)稅發(fā)[2004]88號(hào))規(guī)定：增值稅一般納稅人取得的貨物運(yùn)輸業(yè)發(fā)票，可以在自發(fā)票開具日90天后的第一個(gè)納稅申報(bào)期結(jié)束以前申報(bào)抵扣。

增值稅一般納稅人在2004年3月1日以后取得的貨物運(yùn)輸業(yè)發(fā)票，必須按照《增值稅運(yùn)費(fèi)發(fā)票抵扣清單》的要求填寫全部?jī)?nèi)容，對(duì)填寫內(nèi)容不全的不得予以抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。

《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于加強(qiáng)貨物運(yùn)輸業(yè)稅收征收管理的通知》(國(guó)稅發(fā)[2003]121號(hào))中附件2《運(yùn)輸發(fā)票增值稅抵扣管理試行辦法》第4條規(guī)定：納稅人取得所有需計(jì)算抵扣增值。