相關(guān)法律中缺乏對公共利益內(nèi)容、權(quán)限的界定標(biāo)準(zhǔn)。我國《憲法》《土地管理法》中對農(nóng)村集體土地轉(zhuǎn)讓補(bǔ)償有明確規(guī)定，但對公共利益內(nèi)容和方式、程序與權(quán)限界定不清。在《憲法》中明確提到因公共利益需求進(jìn)行的征用應(yīng)給予相應(yīng)補(bǔ)償。《土地管理法》第二十三條進(jìn)一步對公益建設(shè)占地進(jìn)行分類，符合規(guī)定項(xiàng)目才能征用集體土地，商業(yè)項(xiàng)目無權(quán)征用土地，需要申請國有建設(shè)用地，但是沒有列舉哪些類型符合公共利益項(xiàng)目，也沒有具體規(guī)定符合公共利益的外延范圍，只能通過地方政府裁決是否進(jìn)行征用補(bǔ)償。由于法律中缺乏對公共利益的界定和運(yùn)行步驟，導(dǎo)致一些征地項(xiàng)目以公共利益為幌子，實(shí)際是以商業(yè)利益為目的，有的征地前后土地用途不一致，而相關(guān)法律沒有對應(yīng)的彌補(bǔ)和懲罰機(jī)制，這些都是缺乏詳細(xì)法律規(guī)定所致。

土地征收補(bǔ)償問題較多。土地征收補(bǔ)償問題主要包括征收補(bǔ)償范圍小、征收補(bǔ)償標(biāo)準(zhǔn)不合理、征收補(bǔ)償程序不健全等幾個(gè)方面。

在有關(guān)土地征收補(bǔ)償依據(jù)上，相關(guān)法律規(guī)定對土地征收要給予一定經(jīng)濟(jì)補(bǔ)償，主要是土地補(bǔ)償費(fèi)、青苗補(bǔ)償費(fèi)、安置補(bǔ)貼費(fèi)，由于土地補(bǔ)償只占征地項(xiàng)目成本較少一部分，但卻是廣大失地農(nóng)民獲得補(bǔ)償比重最大的一項(xiàng)，如依據(jù)當(dāng)前農(nóng)民收益來計(jì)算土地征收補(bǔ)償，每人獲得的補(bǔ)償資金并不多，不能與土地轉(zhuǎn)讓后產(chǎn)生的巨大經(jīng)濟(jì)價(jià)值相匹配，失地農(nóng)民潛在損失的利益很大。土地征收補(bǔ)償標(biāo)準(zhǔn)制定不合理導(dǎo)致實(shí)際土地補(bǔ)償費(fèi)用和土地增值產(chǎn)值聯(lián)系不大。土地征收補(bǔ)償程序仍不完善，執(zhí)法人員能力素質(zhì)偏低，在工作中會出現(xiàn)貪腐和以人情、金錢左右征地的行為，侵害農(nóng)民利益的現(xiàn)象時(shí)有發(fā)生。

失地農(nóng)民安置和補(bǔ)償爭議缺乏司法有效保護(hù)。對失地農(nóng)民補(bǔ)償安置在我國《憲法》第十條中有具體規(guī)定，不同地區(qū)多依據(jù)《憲法》條例采用一次性貨幣補(bǔ)償，并沒有涉及其社保、就業(yè)等公共服務(wù)內(nèi)容。這種一次性貨幣補(bǔ)償只考慮了征地補(bǔ)償費(fèi)用，沒有關(guān)注失地農(nóng)民今后的生活保障問題。如果農(nóng)民失地后不能找到穩(wěn)定工作，征地補(bǔ)償款將成為生活依仗越用越少，如突遇重大疾病或重大事故，必然難以承擔(dān)。

由于土地征收補(bǔ)償中涉及諸多問題，導(dǎo)致矛盾糾紛層出不窮，而法律中缺乏相關(guān)司法救濟(jì)程序，一些征地補(bǔ)償糾紛無法通過人民法院起訴解決，只能尋求地方政府征收部門進(jìn)行裁定。處理糾紛方式方法相對不足，當(dāng)征地雙方在補(bǔ)償問題上達(dá)不成一致時(shí)，農(nóng)民合法權(quán)益難以獲得有效保障。