依照刑法第二百二十五條的規(guī)定，犯非法經(jīng)營罪的，處五年以下有期徒刑或者拘役，并處或者單處違法所得1倍以上5倍以下罰金;情節(jié)特別嚴重的，處五年以上有期徒刑，并處違法所得1倍以上5倍以下罰金或者沒收財產(chǎn)。

依照刑法第二百三十一條的規(guī)定，單位犯本罪的，對單位判處罰金，并對直接負責人員和其他直接責任人員依照刑法第二百二十五條的規(guī)定處罰。

司法機關在適用上述規(guī)定處罰時，應當注意以下幾個問題：

1、正確認定“情節(jié)特別嚴重”。在司法實踐中，所謂情節(jié)特別嚴重，一般是指非法經(jīng)營數(shù)額或者非法獲利額特別巨大的;造成特別嚴重后果的;造成十分惡劣影響的;對國民經(jīng)濟和社會安定造成嚴重破壞的，等等。

2、要注意適用財產(chǎn)刑。刑法明確規(guī)定本罪的罰金數(shù)額為違法所得一倍以上五倍以下，刑法　了在經(jīng)濟上予以重罰的立法精神。因此，司法機關要注意刑法處或者單處財產(chǎn)刑，從經(jīng)濟上制裁犯罪分子刑法

3、根據(jù)全國人大常委會關于懲治騙取外匯、逃匯和非法買賣外匯犯罪的決定第四條第一款的規(guī)定刑法在國家規(guī)定的交易場所以外非法買賣外匯刑法擾亂市場秩序，情節(jié)刑法的，依照刑法第二百二十五條的規(guī)定刑法以非法經(jīng)營罪定罪處罰⑦。

4、根據(jù)“兩高的解釋，⑧違反國家的預防、控制突發(fā)傳染病疫情等災害期間有關市場經(jīng)營、價格管理等規(guī)定，哄抬物價、牟取暴利，嚴重擾亂市場秩序，違法　所得數(shù)額較大或者有其他嚴重情節(jié)的，依照刑法第二百二十五條第(四)項的規(guī)定，以非法經(jīng)營罪定罪，從重處罰。

5、按照上述兩高、一部《辦理非法經(jīng)營國際電信業(yè)務犯罪案件聯(lián)席會議經(jīng)紀要》⑨的意見，獲得國際電信業(yè)務經(jīng)營許可的經(jīng)營者(含涉港澳臺電信業(yè)務經(jīng)營者)明知他人非法從事國際電信業(yè)務，仍違反國家規(guī)定，采取出租、合作、授權等手段，為他人提供經(jīng)營和技術條件，利用現(xiàn)有設備或另設國際話務轉(zhuǎn)接設備并從中營利，情節(jié)嚴重的，應以非法經(jīng)營罪的共犯追究刑事責任。