但根據(jù)《工作指引》，國(guó)家高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)區(qū)（含北京新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)試驗(yàn)區(qū)）內(nèi)外按照原認(rèn)定辦法認(rèn)定并在2007年底前仍有效的高新技術(shù)企業(yè)資質(zhì)，根據(jù)《中華人民共和國(guó)企業(yè)所得稅法》及其實(shí)施條例的“認(rèn)定辦法”和“工作指引”等有關(guān)規(guī)定，企業(yè)經(jīng)重新認(rèn)定合格后，方可享受企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策。企業(yè)也可以在資格期滿后申請(qǐng)重新確認(rèn)，但根據(jù)《國(guó)務(wù)院關(guān)于實(shí)施企業(yè)所得稅過(guò)渡性優(yōu)惠政策的通知》（國(guó)發(fā)[2007]39號(hào)），從2008年1月1日起，重新確認(rèn)期間只能執(zhí)行25%的稅率，2007年3月16日前經(jīng)工商登記機(jī)關(guān)登記設(shè)立的企業(yè)，可享受“兩免三減半”、“五免五減半”等過(guò)渡性優(yōu)惠政策，依照原稅收法律、行政法規(guī)和有關(guān)文件規(guī)定繼續(xù)享受優(yōu)惠直至期滿，但因無(wú)利潤(rùn)未享受優(yōu)惠的，優(yōu)惠期從2008年起計(jì)算，2006年在北京市新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)試驗(yàn)區(qū)設(shè)立的企業(yè)，在2007年底前取得高新技術(shù)企業(yè)資格的，在過(guò)渡期內(nèi)，該資格一直有效。目前，對(duì)于企業(yè)在過(guò)渡期內(nèi)是否需要重新認(rèn)定才能繼續(xù)享受過(guò)渡優(yōu)惠，有兩種觀點(diǎn)：一種觀點(diǎn)認(rèn)為企業(yè)的高新技術(shù)資格在過(guò)渡期內(nèi)有效，而國(guó)發(fā)[2007]39號(hào)文件規(guī)定，過(guò)渡期前企業(yè)可以享受稅收優(yōu)惠，無(wú)需重新認(rèn)定。如果企業(yè)在原高新技術(shù)企業(yè)資質(zhì)到期后，未能獲得高新技術(shù)企業(yè)資質(zhì)認(rèn)定，則即使在過(guò)渡期，企業(yè)還應(yīng)適用25%的企業(yè)所得稅稅率

另一種觀點(diǎn)是，即使企業(yè)在過(guò)渡期內(nèi)仍處于39號(hào)文件所述的減免稅期間，也處于原高新技術(shù)企業(yè)資格的有效期內(nèi)，在繼續(xù)享受39號(hào)文件中提到的減免稅優(yōu)惠政策之前，應(yīng)及時(shí)予以重新認(rèn)定，筆者更傾向于第二種觀點(diǎn)。過(guò)渡期企業(yè)繼續(xù)享受優(yōu)惠政策的前提是過(guò)渡期企業(yè)各項(xiàng)指標(biāo)符合《認(rèn)定辦法》規(guī)定的標(biāo)準(zhǔn)?！豆ぷ髦敢非把赃€強(qiáng)調(diào)，“2007年底以前，國(guó)家高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)區(qū)進(jìn)出口的高新技術(shù)企業(yè)，按照原認(rèn)定辦法認(rèn)定的，仍然有效的，但是，企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策只有按照認(rèn)定辦法和工作指南重新認(rèn)定合格后，才能按照《中華人民共和國(guó)企業(yè)所得稅法》及其實(shí)施條例的有關(guān)規(guī)定享受?！逼髽I(yè)如何正確認(rèn)識(shí)和經(jīng)營(yíng)，還需要等待總局相關(guān)文件的明確

此外，國(guó)發(fā)[2007]40號(hào)文件規(guī)定，在深圳、珠海、汕頭、廈門、海南經(jīng)濟(jì)特區(qū)、上海浦東新區(qū)注冊(cè)的高新技術(shù)企業(yè)收入，需要國(guó)家重點(diǎn)扶持的，從第一個(gè)生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)收入納稅年度起繳納，享受“兩免三減半”優(yōu)惠政策（25%分）

合格研發(fā)費(fèi)用的范圍在認(rèn)定方法和工作指南中有明確規(guī)定和列出。企業(yè)應(yīng)當(dāng)按照財(cái)企[2007]194號(hào)《關(guān)于加強(qiáng)研發(fā)費(fèi)用財(cái)務(wù)管理的意見(jiàn)》的規(guī)定收取研發(fā)費(fèi)用，按照《辦法和指引》確定的研發(fā)費(fèi)用剛性指標(biāo)，做好研發(fā)費(fèi)用預(yù)算和計(jì)劃。應(yīng)特別注意以下四個(gè)指標(biāo)：

1。過(guò)去三個(gè)會(huì)計(jì)年度研發(fā)費(fèi)用總額占銷售收入總額的比例符合下列要求：

a。最近一年銷售收入在5000萬(wàn)元以下的企業(yè)比例不低于6%