1、適用范圍不同。預(yù)算會(huì)計(jì)適用于各級政府財(cái)政部門、各級行政單位和各類事業(yè)單位，適用對象具有明顯的非營利性，所以又稱為非營利性組織會(huì)計(jì)。企業(yè)以盈利為目標(biāo)，企業(yè)會(huì)計(jì)又稱為營利性組織會(huì)計(jì)。

2、會(huì)計(jì)核算的基礎(chǔ)不同。預(yù)算會(huì)計(jì)中，財(cái)政總預(yù)算會(huì)計(jì)和行政單位會(huì)計(jì)以收付實(shí)現(xiàn)制作為記賬基礎(chǔ);事業(yè)單位會(huì)計(jì)根據(jù)單位實(shí)際情況采用不同的記賬基礎(chǔ)，不進(jìn)行經(jīng)營活動(dòng)的事業(yè)單位會(huì)計(jì)以收付實(shí)現(xiàn)制作為記賬基礎(chǔ);進(jìn)行經(jīng)營活動(dòng)的事業(yè)單位會(huì)計(jì)對非營利活動(dòng)會(huì)計(jì)以收付實(shí)現(xiàn)制作為記賬基礎(chǔ)，對營利活動(dòng)以權(quán)責(zé)發(fā)生制作為記賬基礎(chǔ)。企業(yè)會(huì)計(jì)必須采用權(quán)責(zé)發(fā)生制作為記賬基礎(chǔ)。

3、會(huì)計(jì)要素構(gòu)成不同。預(yù)算會(huì)計(jì)要素分為五大類，即資產(chǎn)、負(fù)債、凈資產(chǎn)、收入和支出。企業(yè)會(huì)計(jì)要素分為六大類，即資產(chǎn)、負(fù)債、所有者權(quán)益、收入、費(fèi)用和利潤。除會(huì)計(jì)要素?cái)?shù)量不同外，即使會(huì)計(jì)要素名稱相同，預(yù)算會(huì)計(jì)與企業(yè)會(huì)計(jì)在核算內(nèi)容上也存在較大差異。

4、會(huì)計(jì)等式不同。預(yù)算會(huì)計(jì)的會(huì)計(jì)恒等式為：資產(chǎn)+支出=負(fù)債+凈資產(chǎn)+收入。企業(yè)會(huì)計(jì)的會(huì)計(jì)恒等式為：資產(chǎn)=負(fù)債+所有者權(quán)益。

5、會(huì)計(jì)核算原則、內(nèi)容及方法具有特殊性。在預(yù)算會(huì)計(jì)中，執(zhí)行?？顚Ｓ玫脑瓌t。?？顚Ｓ迷瓌t是指對國家預(yù)算撥款和其他指定用途的資金，必須按規(guī)定的用途使用，不得擅自改變用途、挪作他用。預(yù)算會(huì)計(jì)在核算內(nèi)容和方法上不僅與企業(yè)會(huì)計(jì)有很大差異，而且政府預(yù)算會(huì)計(jì)、行政單位會(huì)計(jì)、事業(yè)單位會(huì)計(jì)之間也有很大差別。

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