當(dāng)專利權(quán)受到侵害時(shí)，有三個(gè)選擇：自行協(xié)商解決，到人民法院起訴或者請(qǐng)求專利局進(jìn)行處理。

第六十條未經(jīng)專利權(quán)人許可，實(shí)施其專利，即侵犯其專利權(quán)，引起糾紛的，由當(dāng)事人協(xié)商解決;不愿協(xié)商或者協(xié)商不成的，專利權(quán)人或者利害關(guān)系人可以向人民法院起訴，也可以請(qǐng)求管理專利工作的部門處理。管理專利工作的部門處理時(shí)，認(rèn)定侵權(quán)行為成立的，可以責(zé)令侵權(quán)人立即停止侵權(quán)行為，當(dāng)事人不服的，可以自收到處理通知之日起十五日內(nèi)依照《中華人民共和國(guó)行政訴訟法》向人民法院起訴;侵權(quán)人期滿不起訴又不停止侵權(quán)行為的，管理專利工作的部門可以申請(qǐng)人民法院強(qiáng)制執(zhí)行。進(jìn)行處理的管理專利工作的部門應(yīng)當(dāng)事人的請(qǐng)求，可以就侵犯專利權(quán)的賠償數(shù)額進(jìn)行調(diào)解;調(diào)解不成的，當(dāng)事人可以依照《中華人民共和國(guó)民事訴訟法》向人民法院起訴。

專利侵權(quán)糾紛涉及新產(chǎn)品制造方法的發(fā)明專利的，制造同樣產(chǎn)品的單位或者個(gè)人應(yīng)當(dāng)提供其產(chǎn)品制造方法不同于專利方法的證明;涉及實(shí)用新型專利的，人民法院或者管理專利工作的部門可以要求專利權(quán)人出具由國(guó)務(wù)院專利行政部門作出的檢索報(bào)告。

選擇司法保護(hù)和行政保護(hù)之前，應(yīng)先明白到人民法院起訴與請(qǐng)求專利局兩者之間的差異：

1、專利管理機(jī)關(guān)在處理專利侵權(quán)時(shí)，雖然有權(quán)責(zé)令侵權(quán)人停止侵權(quán)行為，并賠償損失，但這種處理不是終局的，只要當(dāng)事人有一方不服的(可能是專利權(quán)人，也可能是被控侵權(quán)人)，他在收到專利局的處理通知之日起三個(gè)月內(nèi)，可以向法院起訴。只有當(dāng)雙方當(dāng)事人對(duì)專利局的處理決定表示接受或者在規(guī)定的起訴期間內(nèi)沒(méi)有到法院起訴，該處理決定才算具有法律效力;法院對(duì)專利侵權(quán)的判決是終局的，其他任何機(jī)關(guān)不能改變這種判決。

2、專利局的救濟(jì)手段有限，只能責(zé)令侵權(quán)人停止侵權(quán)和賠償損失;而法院可以行使《民法通則》規(guī)定的一切民事救濟(jì)手段。

3、行政處理具有主動(dòng)性的優(yōu)勢(shì)，簡(jiǎn)便、快捷、高效;而法院則實(shí)行“不告不理”，當(dāng)事人必須做好充分的訴前準(zhǔn)備，否則將會(huì)面臨證據(jù)不足的尷尬。