人民法院審理自訴案件的程序與審理一般公訴案件的程序有所不同，主要是：

1.人民法院接到自訴案件以后，應(yīng)當(dāng)進行審查，區(qū)別案件情況予以處理：(1)對于犯罪事實清楚，有足夠證據(jù)的案件，應(yīng)當(dāng)開庭審判，作出被告人有罪或者無罪的判決;(2)對于被害人指控被告人犯罪的證據(jù)不足或者沒有證據(jù)的，應(yīng)當(dāng)讓自訴人提出補充證據(jù)，自訴人提不出補充證據(jù)的，應(yīng)當(dāng)說服自訴人撤回起訴，或者裁定駁回自訴人的起訴。

2.人民法院受理自訴案件后，自訴人經(jīng)法庭兩次合法傳喚，沒有正當(dāng)理由而故意拒不到庭的，或者在法庭審理中未經(jīng)法庭許可中途退庭的，按照自訴人撤回起訴處理。

3.人民法院對自訴案件，可以進行調(diào)解;自訴人在宣告判決以前，可以同被告人自行和解或者撤回起訴。通過法院調(diào)解，自訴人同被告人和解或者自訴人與被告人自行和解或者自訴人撤回起訴的，法院就不再追究被告人的刑事責(zé)任。這也是自訴案件與公訴案件重要區(qū)別之一。這樣規(guī)定是考慮到自訴案件有其自身特點，一般是很輕微的刑事案件，為減少爭訟，有利于社會、家庭的安定作出這樣的規(guī)定。

4.對于被害人有證據(jù)證明對被告人侵犯自己人身、財產(chǎn)權(quán)利的行為應(yīng)當(dāng)依法追究刑事責(zé)任，而公安機關(guān)或者人民檢察院不追究被告人刑事責(zé)任的自訴案件，人民法院不能進行調(diào)解，應(yīng)當(dāng)依法予以處理。因為這類自訴案件是公安機關(guān)、檢察機關(guān)沒有履行職責(zé)，該管不管的案件，而且其中有些案件從性質(zhì)上說應(yīng)當(dāng)是公訴案件，只是因為公安機關(guān)、檢察機關(guān)不履行自己的職責(zé)，為了解決老百姓告狀無門的問題，懲罰犯罪，才由法律規(guī)定被害人可以直接控訴到人民法院，所以人民法院在審理這類自訴案件時，不能適用調(diào)解。如果其中有屬于告訴才處理的案件或者是輕微的刑事案件，可以允許自訴人和被告人自行和解或者自訴人撤回自訴。

5.自訴案件的被告人在訴訟過程中，可以對自訴人提起反訴，即被告人可以就自訴人控告的案件的有關(guān)事實對自訴人提起刑事訴訟。反訴適用法律關(guān)于自訴的所有規(guī)定。