刑事訴訟職能管轄，又稱部門管轄或者立案管轄，是指公安機關(guān)、人民檢察院和人民法院之間立案受理刑事案件上的分工。

1、公安機關(guān)偵查的刑事案件

《刑事訴訟法》第18條第1款規(guī)定：“刑事案件的偵查由公安機關(guān)進(jìn)行，法律另有規(guī)定的除外?！备鶕?jù)這一規(guī)定，除了法律另有規(guī)定外，公安機關(guān)是刑事案件的主要偵查機關(guān)。法律的這一規(guī)定是有其實際根據(jù)的：公安機關(guān)是國家的治安保衛(wèi)機關(guān)，負(fù)有維護(hù)社會秩序、保衛(wèi)國家安全的任務(wù)，它擁有龐大而嚴(yán)密的組織體系和足夠的警力，專門的偵查手續(xù)和措施，具有良好的控制社會治安局勢和快速反應(yīng)的能力，并且在長期的同各種危害社會治安秩序的犯罪行為作斗爭的過程中積累了豐富的經(jīng)驗。因此，將絕大多數(shù)的刑事案件交給公安機關(guān)偵查，便于發(fā)揮公安機關(guān)維護(hù)社會治安的作用。對于某些特定的刑事案件，法律規(guī)定由其他國家機關(guān)進(jìn)行偵查。如人民檢察院依法對其直接受理的刑事案件進(jìn)行偵查;國家安全機關(guān)負(fù)責(zé)對危害國家安全的刑事案件進(jìn)行偵查;軍隊保衛(wèi)部門對軍隊內(nèi)部發(fā)生的刑事案件行使偵查權(quán);監(jiān)獄對罪犯在監(jiān)獄內(nèi)犯罪的刑事案件進(jìn)行偵查，等等。這些特定的刑事案件占整個刑事案件的比例是比較小的。

2、人民檢察院直接受理偵查的刑事案件

《刑事訴訟法》第18條第2款規(guī)定：“貪污賄賂犯罪，國家工作人員的瀆職犯罪，國家機關(guān)工作人員利用職權(quán)實施的非法拘禁、刑訊逼供、報復(fù)陷害、非法搜查、侵犯公民人身權(quán)利的犯罪以及侵犯公民民主權(quán)的犯罪，由人民檢察院立案偵查?！狈蛇@樣規(guī)定，一方面有利于檢察機關(guān)集中力量對貪污、賄賂、國家工作人員的瀆職等犯罪案件進(jìn)行偵查，突出工作重點，加強反腐敗斗爭;另一方面有利于檢察機關(guān)加強對公安機關(guān)偵查活動的監(jiān)督。

根據(jù)檢察機關(guān)是國家法律監(jiān)督機關(guān)和公、檢、法三機關(guān)分工負(fù)責(zé)、互相制約的原則，檢察機關(guān)自偵查案件的范圍，主要還是局限于國家機關(guān)工作人員利用職務(wù)的犯罪。除了上面提到的檢察機關(guān)直接受理偵查的幾種刑事案件以外，《刑事訴訟法》第18條還規(guī)定：“對于國家機關(guān)工作人員利用職權(quán)實施的其他重大的犯罪案件，需要由人民檢察院直接受理的時候，經(jīng)省級以上人民檢察院決定，可以由人民檢察院直接受理的時候，經(jīng)省級以上人民檢察院決定，可以由人民檢察院立案偵查?！边@不是一般的案件分類管轄劃分的條款規(guī)定，而是檢察機關(guān)根據(jù)法律監(jiān)督職權(quán)對個案的監(jiān)督條款，以糾正有案不立，有罪不究和司法實踐中存在的腐敗現(xiàn)象。這也不是檢察機關(guān)包攬其他機關(guān)的偵查權(quán)，而是通過這種方式加強執(zhí)法監(jiān)督，促使其他機關(guān)嚴(yán)格執(zhí)法，使所有犯罪都毫無例外地受到追究，維護(hù)國家法律的尊嚴(yán)和統(tǒng)一。