(一)申報階段

排污者必須在每年1月15日前向環(huán)境監(jiān)察機構(gòu)申報正常作業(yè)條件下的排污情況，按要求填報《排污申報登記表》，并提供必要的資料。

新建、擴建、改建項目，應(yīng)當(dāng)在項目試生產(chǎn)前3個月內(nèi)辦理排污申報手續(xù)。在城市市區(qū)范圍內(nèi)，建筑施工過程中使用機械設(shè)備，可能產(chǎn)生環(huán)境噪聲污染的，施工單位必須在工程開工15日前辦理排污申報手續(xù)。

排污者申報、登記后，當(dāng)排污者排放污染物需作改變或者發(fā)生污染事故等造成污染物排放經(jīng)濟變化的，必須分別在改變3日前或變化后3日內(nèi)填報《排污申報變更登記表》，說明變更原因，履行變更申報手續(xù)。

(二)審核階段

環(huán)境監(jiān)察機構(gòu)應(yīng)當(dāng)按照國家規(guī)定強制檢定的污染物排放自動監(jiān)控儀器數(shù)據(jù)、監(jiān)督性監(jiān)測數(shù)據(jù)或物料衡算數(shù)據(jù)對排污者填報的《排污申報登記表》進行審核。經(jīng)審核，符合規(guī)定要求的，環(huán)境監(jiān)察機構(gòu)向排污者發(fā)放經(jīng)審核同意的《排污申報登記表》;不符合規(guī)定要求的，責(zé)令排污者限期補報;逾期未報的，視為拒報。

(三)排污量的核定

環(huán)境監(jiān)察機構(gòu)應(yīng)在每月或每季度終了后10日內(nèi)，依據(jù)《排污申報登記表》，結(jié)合當(dāng)月或當(dāng)季的實際排污情況，核定排污者排放污染物的種類、數(shù)量，并向排污者送達《排污核定通知書》。

排污者對核定結(jié)果有異議的，自接到《排污核定通知書》之日起7日內(nèi)，向發(fā)出通知的環(huán)境監(jiān)察機構(gòu)申請復(fù)核;環(huán)境監(jiān)察機構(gòu)應(yīng)當(dāng)自接到復(fù)核申請之日起10日內(nèi)作出復(fù)核決定，并將《排污量申報登記復(fù)核通知書》送達排污者。

(四)征收排污費

1、排污費按月或按季度征收。

2、環(huán)境監(jiān)察機構(gòu)根據(jù)排污量申報登記核定結(jié)果和排污費征收標(biāo)準(zhǔn)計算確定排污費，并將排污者的名稱、收費時段和收費數(shù)額予以公告。

3、排污費數(shù)額經(jīng)環(huán)境監(jiān)察機構(gòu)確定、復(fù)核后，由環(huán)境監(jiān)察機構(gòu)向排污者送達《排污費繳納通知單》。

4、排污者應(yīng)當(dāng)自接到《排污費繳納通知單》之日起7日內(nèi)，到指定的商業(yè)銀行填寫“一般繳款書”繳納排污費。排污者在規(guī)定的期限內(nèi)未足額繳納排污費的，由收繳部門責(zé)令其限期繳納，并從滯納之日起加收2‰的滯納金;逾期拒不繳納的，處應(yīng)繳納排污費數(shù)額1倍以上3倍以下的罰款，并報經(jīng)有批準(zhǔn)權(quán)的人民政府批準(zhǔn)，責(zé)令停產(chǎn)停業(yè)整頓。

(五)排污費減繳、免繳、緩繳。

排污者因不可抗力遭受重大經(jīng)濟損失的，可以向有審批權(quán)限的上級環(huán)保部門申請減半繳納排污費或者免繳排污費;排污者因未及時采取有效措施，造成環(huán)境污染的，不得申請減半繳納排污費或者免繳排污費。排污者因有特殊困難不能按期繳納排污費的，自接到排污費繳納通知單之日起7日內(nèi)，可以向發(fā)出繳費通知單的環(huán)境保護行政主管部門申請緩繳排污費;環(huán)境保護行政主管部門應(yīng)當(dāng)自接到申請之日起7日內(nèi)，作出書面決定;期滿未作出決定的，視為同意;排污費的緩繳期限最長不超過3個月。批準(zhǔn)減繳、免繳、緩繳排污費的排污者名單由受理申請的環(huán)境保護行政主管部門會同同級財政部門、價格主管部門予以公告，公告應(yīng)當(dāng)注明批準(zhǔn)減繳、免繳、緩繳排污費的主要理由。