1、將會(huì)在實(shí)質(zhì)上限制公民的訴訟權(quán)利。在客觀上縮小行政訴訟的范圍。以治安行政案件為例：被處罰人和被侵害人對(duì)治安處罰不服均可以向人民法院提起行政訴訟，被處罰人一般訴請(qǐng)有：要求法院撤銷(xiāo)處罰決定;要求法院減輕處罰;要求法院減少賠償金額。被侵害人的一般訴請(qǐng)則是：要求法院追究加害人的行政責(zé)任;要求法院加重加害人的處罰;要求法院增加賠償金額。如果人民法院不行使司法變更權(quán)，法官在處理行政案件中就只能判決六項(xiàng)中的兩項(xiàng)，即當(dāng)事人要求撤銷(xiāo)處罰決定的申請(qǐng)和要求撤銷(xiāo)賠償裁決的申請(qǐng)。這不僅在實(shí)質(zhì)上縮小了司法監(jiān)督的范圍，而且也限制了公民的訴訟權(quán)利。如果法官敢于大膽行使司法變更權(quán)，直接判決變更行政機(jī)關(guān)的處罰決定，既可以充分的保護(hù)當(dāng)事人的合法權(quán)益，也不會(huì)造成訴累。

2、有一部分行政訴訟會(huì)徒有虛名。當(dāng)事人起訴到人民法院的行政案件，有些行政案件，當(dāng)事人要求減輕處罰或減少賠償金額，但案件受理后行政機(jī)關(guān)的處罰決定絕少“違法”的。因?yàn)榉苫蚍ㄒ?guī)所確定的處罰幅度較寬。這樣，即使行政處罰決定顯失公平，法院撤銷(xiāo)也于法無(wú)據(jù)，只能維持了事。如果法官敢于大膽行使司法變更權(quán)，則可以拓展行政案件的受案范圍。

3、降低行政機(jī)關(guān)的工作效率。行政機(jī)關(guān)處罰決定，有的處罰方式明顯不適當(dāng);有的適用法律不當(dāng);有的忽視從輕、從重情節(jié);有的處罰時(shí)輕時(shí)重等等。人民法院在審理行政案件過(guò)程中，已掌握了該行政案件的基本事實(shí)，以及所依據(jù)的法律、法規(guī)等，具備了改變錯(cuò)誤的行政裁決的條件。如果法院直接變更行政機(jī)關(guān)的行政決定，行政爭(zhēng)議即可得到及時(shí)解決。相反，如果法院撤銷(xiāo)行政機(jī)關(guān)的行政決定，發(fā)回行政機(jī)關(guān)，可以出現(xiàn)解決同一行政案件人為的分成數(shù)次解決，反復(fù)多次，增加當(dāng)事人訴訟成本。

4、會(huì)使公民的合法權(quán)益得不到保障。用撤銷(xiāo)重新作出具體行政行為的方式來(lái)糾正行政機(jī)關(guān)的錯(cuò)誤裁決是建立在兩個(gè)假定的基礎(chǔ)上。一是法院能夠在沒(méi)有任何干擾的情況下作出撤銷(xiāo)決定。二是行政機(jī)關(guān)能依照法院判決及時(shí)重新作出裁決。實(shí)踐證明，法院要撤銷(xiāo)一個(gè)行政決定，會(huì)遇到很多阻力和干預(yù)。有時(shí)法院只作撤銷(xiāo)行政機(jī)關(guān)的行政決定的判決，而沒(méi)有判決行政機(jī)關(guān)限期作出具體行政行為，會(huì)使下一個(gè)行政決定，一拖再拖，甚至不了了之。