1。軟件著作權(quán)登記；2軟件著作權(quán)保護與侵權(quán)認定；三。軟件著作權(quán)在執(zhí)行程序中的問題。軟件著作權(quán)登記、登記機關、登記程序和登記效力、軟件登記的立法缺陷目前，中國版權(quán)局指定的軟件登記主管部門是中國版權(quán)保護中心，中華人民共和國新聞出版總署（國家版權(quán)局）直屬事業(yè)單位，成立于1998年9月。中心目前的基本職責是：計算機軟件及其他作品的著作權(quán)登記、外國音像制品的合同登記、外國音像制品的著作權(quán)鑒定、侵權(quán)作品鑒定、著作權(quán)法律咨詢服務等，中國版權(quán)保護中心在中國設有機構(gòu)，即北京市版權(quán)局

根據(jù)《計算機軟件著作權(quán)登記辦法》中關于軟件著作權(quán)登記的規(guī)定，軟件注冊應當提供的鑒定材料包括程序和文件的鑒定材料。程序和文件的標識材料應包括源程序和任何類型文件前后連續(xù)30頁。如果整個程序和文件少于60頁，則應提交整個源程序和文件。除特殊情況外，程序每頁不得少于50行，文件每頁不得少于30行

在發(fā)生軟件著作權(quán)侵權(quán)糾紛的情況下，僅對軟件界面、目錄結(jié)構(gòu)、，菜單結(jié)構(gòu)和軟件本身的版權(quán)聲明不能確定其權(quán)利的歸屬。當雙方訴諸法律時，法官一般會要求雙方提供軟件的源代碼進行比對，并委托相關部門進行代碼識別。如果一方未能提供可編譯的源代碼，則該方應承擔敗訴的不利后果。但是，如果雙方都能提供軟件的源代碼（通常情況下，一方由于工作或合作關系而聯(lián)系另一方的源代碼）。有必要將雙方的源代碼與軟件注冊部門保留的文件進行比較。但是，如上所述，軟件注冊部門保留的源代碼很少，根本無法比較。因此，目前，計算機軟件侵權(quán)案件的認定極為復雜和困難，司法界目前公認的侵權(quán)盜版軟件的認定方法和步驟是：（1）比較被認定軟件與被認定軟件的軟盤或目錄、文件名的內(nèi)容正版軟件。二者完全一致的，可以認為軟件侵權(quán)人是無手續(xù)擁有和使用軟件的人或者出賣人；如果不完全一致，而只是大致一致，則應在此基礎上執(zhí)行以下步驟。在比較的過程中，要注意三寸盤和五寸盤的區(qū)別。在這種情況下，最好在紙上列出比較的內(nèi)容，以便于識別